وتوضح الدكتورة ماري إيست، خبيرة التغذية، والدكتور أندريه سيماكوف، أخصائي أمراض الجهاز الهضمي والأعصاب، أن القهوة تؤثر في الجهاز الهضمي بعدة طرق، إذ قد تحفز إفراز العصارة المعدية وتزيد نشاط الأمعاء، ما قد يسبب شعورا بعدم الراحة لدى بعض الأشخاص.

ويشير سيماكوف إلى أن القهوة لا تلحق ضررا مباشرا بالغشاء المخاطي للمعدة ولا يمكنها "حرقه"، لكن تأثيرها قد يكون أكثر وضوحا لدى الأشخاص الذين يعانون من فرط حساسية الجهاز الهضمي. وقد تزيد القهوة أعراض متلازمة القولون العصبي لدى بعض المرضى بسبب تأثيرها في حركة الأمعاء، إلا أن الاستجابة تختلف من شخص إلى آخر.

ولا يقتصر تأثير القهوة على الكافيين، فهي تحتوي أيضا على أحماض الكلوروجينيك والتريغونيلين والميلانويدينات، بالإضافة إلى الكافستول والكاهويول. كما تختلف الاستجابة بحسب نوع القهوة وطريقة تحضيرها، إذ تحتوي القهوة غير المفلترة على نسب أعلى من الكافستول والكاهويول.